В структуру Центра входят:
- учебный сектор, основной целью деятельности которого является организация учебного процесса;
- сектор методического обеспечения и контроля качества образования - методическое сопровождение учебного процесса и контроль качества обучения;
- информационно-технический сектор- формирование информационно-образовательной среды, обеспечивающей эффективное взаимодействие между всеми субъектами образовательного процесса;
- сектор электронного обучения и дистанционных образовательных технологий- применение и развитие системы электронного обучения, а также внедрение дистанционных образовательных технологий и цифровых сервисов и инструментов в образовательную и административную деятельность Центра.